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「WB急救室」之条带弱、无信号,蛋白样品的5大雷区,你踩过吗?

184 人阅读发布时间:2026-03-24 16:11

WB,Western Blot

一个科研界的「神级」实验,科研人的「老朋友」

却总是不经意的给你带来「致命痛苦」

条带弱、无信号、背景高、抗体失效……

一旦失败,就是36小时的再等待

不说影响论文进度,身心的煎熬有谁懂?

现在,「WB急救室」专题正式上线!我们将聚焦WB实验中的高频故障场景,以「急诊式」内容直击痛点。前面的文章,我们解析了一抗选择及使用二抗选择等方面的“坑”,接下来我们深挖一下蛋白样品相关的“雷区”吧!

 

 

问题一:蛋白上样量少

图片
 
解决方法

WB每条泳道总蛋白的上样量通常为20-50μg,磷酸化蛋白可能需要50μg。保证蛋白质量的同时,上样体积不宜过多,一般为5-10μL。那么如何保证5-10μL上样液体中含有20-50μg的蛋白呢?

 

首先需要通过BCA或Bradford法精确测定蛋白浓度,然后根据蛋白浓度选择等质量或等体积上样。

 

· 等质量上样:如表格所示已测定4种样品的蛋白浓度,每个泳道的上样量为30 μg,则每个样品的上样量分别为:3.99 μL、5.74 μL、4.61 μL、2.48 μL。

 

 

样品1

样品2

样品3

样品4

蛋白浓度(μg/μL)

9.41

6.54

8.12

15.14

蛋白体积(μL)

3.19

4.59

3.69

1.98

5x loading buffer

体积(μL)

0.8

1.15

0.92

0.5

电泳上样量(μL)

3.99

5.74

4.61

2.48

 

以上虽然保证了蛋白质量一致,但由于浓度不一样,蛋白迁移率可能会不同,造成条带形状不一。并且高浓度蛋白的上样量很少,增加了取液难度。如果蛋白浓度过低,上样量可能会超过梳子孔的最大体积。

 

· 等体积上样:用提取蛋白的裂解液或超纯水稀释样品,使样品浓度达到一致。稀释浓度必须比所有样品中最低的值还要低,比如以上4个样品中最低为6.54 μg/μL,所以我们可以统一稀释到5 μg/μL,下表为制备100 μL样品所需蛋白样本和裂解液体积。稀释后的样品可分装为10 μL,每份加入2.5 μL的5 x loading buffer处理后,按照5 μL或10 μL等体积上样。

 

 

样品1

样品2

样品3

样品4

蛋白浓度(μg/μL)

9.41

6.54

8.12

15.14

蛋白原液体积(μL)

53.13

76.45

61.58

33.03

裂解液或超纯水体积(μL)

0.8

1.15

0.92

0.5

 

问题二:蛋白样本发生降解(膜看起来会比较脏)

 

图片
 
解决方法

在细胞破碎时,蛋白水解酶被释放或激活,在实验过程中或样品长期保存时,可能会使蛋白降解,影响最终的实验结果,因此蛋白酶抑制剂需要在细胞裂解前加入。常用的蛋白酶抑制剂有PMSF、AEBSF、抑肽酶等。PMSF需溶于有机溶剂(如异丙醇),水溶液中易失活,需现用现配,毒性较强,操作时请做好防护。

 

使用较强的蛋白质提取裂解液,可降低蛋白降解概率。SDS裂解液含有10%的SDS,具有强裂解效果,能够破坏蛋白质的空间结构,裂解时间短,用于裂解困难或容易降解的样品,但仅推荐用于WB实验。强RIPA裂解液相对温和,使用范围更广,主要有效成分为:1% TritonX-100、1% 脱氧胆酸钠、0.1% SDS。

 

除此之外,样本制备过程需全程置于冰上或4℃环境下操作。

 

问题三:目标蛋白不存在或表达量低

 

图片
 
解决方法

通过文献资料或数据库(如HPA)确认目的蛋白在样本中的表达情况,更换高表达细胞系,如HEK293过表达体系。还可以通过优化密码子、选择强启动子等基因工程技术提高蛋白质表达。优化诱导条件也能提高蛋白表达,如适当提高IPTG浓度(0.5-1 mM)可增强原核细胞表达,大肠杆菌在37℃诱导4-6小时可提高表达量。目的蛋白表达量较低或难提取时,可根据其在细胞中的定位,进行富集。

 

问题四:蛋白变性不完全

 
解决方法

确保缓冲液含有足够的SDS,并充分煮沸样品。常规条件:100℃煮沸5-10分钟,难变性蛋白可延长至15分钟。含有DTT或β-巯基乙醇的溶液要现用现配,避免还原剂氧化失效。缓冲液pH值需维持在6.8-7.4,以保证SDS的结合效率。

 

问题五:蛋白裂解不充分

 
解决方法

选择裂解强度适当的裂解液。裂解液强度主要与去污剂的种类和浓度有关。在细胞裂解时可配合使用NP-40、TritonX-100、SDS和脱氧胆酸钠这四种去垢剂。NP-40和TritonX-100属于非离子型去污剂,在1%浓度下有效破坏细胞膜。SDS和脱氧胆酸钠属于离子型去污剂。SDS能完全破坏细胞膜、细胞核,WB实验中其工作浓度通常为1-2%。脱氧胆酸钠适用于难溶于水的蛋白,如膜蛋白、核蛋白、脂蛋白等,工作浓度通常为0.25-1%。

 

单次裂解细胞不宜过多,义翘神州选择2x107个细胞/mL。

 

超声处理要充分,以裂解液变得清澈不黏稠为准。细胞培养物超声处理选择多次短暂循环方式,如打1-3秒停2-5秒,重复5-10次,超声裂解过程中在冰上操作,避免样本发热。

 

关于WB条带弱、无信号这一常见“疑难杂症”,我们已经从一抗、二抗、样品蛋白三个维度进行了解析。在你的实验操作中是否还遇到过其他的问题造成检测结果差吗

 

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