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20 人阅读发布时间:2026-03-25 10:54
俗话说,万事开头难,好的开始等于成功了一半!
蛋白质提取,作为Western Blot实验的第一步,可谓是“千里之行始于足下”。
在蛋白提取的过程中,我们是不是常会遇到这样的问题:
明明细胞密度足够好,为什么提取的蛋白样品浓度这么低?
WB忙活三四天,条带千奇百怪,难道WB真是玄学?
这里我们就不得不说一说:裂解液了。
01 裂解液的“超级功效”
合适的裂解液需要具备哪些功能呢?
1)破坏细胞膜:利用去污剂破坏膜脂质双分子层,使细胞裂解,释放内部的蛋白质、核酸等。
2)溶解蛋白质:模拟生理状况下的离子强度,防止蛋白质因盐析出现沉淀。
3)稳定蛋白质:通过特定的缓冲液,提供稳定蛋白的pH值和盐离子环境。
4)防止蛋白质降解:添加蛋白酶或磷酸酶抑制剂,减少细胞裂解过程中的蛋白质降解或发生去磷酸化。
因此,功能齐全的裂解液需要包含去污剂、缓冲体系、盐离子和酶抑制剂。
通常选用近似生理的pH 7.4和20-50 mM的离子强度来作缓冲体系。Tris-HCl缓冲液因其缓冲能力强、不易形成不溶物、兼容性好,而成为裂解液的选择。使用100mM-200mM的NaCl来模拟生理状况下的离子强度。过高的离子浓度会导致泳道内局部电流过大,最终跑出笑脸状条带。
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常用裂解液组分 |
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缓冲体系 |
50mM Tris-HCl pH 7.4 |
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等渗体系 |
100-150 mM NaCl |
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强变性剂和溶解剂 |
0.1% SDS |
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中度变性剂和溶解剂 |
1% Sodium deoxycholate |
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弱变性剂 |
1% Triton X-100 |
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蛋白酶抑制剂 |
1mM PMSF |
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金属酶抑制剂 |
1mM EDTA |
02 8种裂解液的“个性档案”
封闭液的选择,需要从靶蛋白特性、抗体特性、检测灵敏度及成本时效等维度进行考虑。比如高浓度的封闭液在降低背景的同时也会降低信号,因此低丰度蛋白最好使用低浓度的封闭液。如果抗体对BSA有交叉反应,选择脱脂奶粉可能更合适。如果实验要求背景信号极低,建议选择使用高纯度的BSA或鱼明胶。成本方面,脱脂奶粉较为经济。(在上一篇中,我们对6种封闭液进行了“大比武”,这里进行了归纳总结。对封闭液详情感兴趣的宝子们,可以查看“轻松搞定封闭液:6种类型大比武,助你WB实验封闭液选择不再愁”一文。)
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考量因素 |
避坑选择 |
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靶蛋白特性 |
磷酸化蛋白检测不能使用含酪蛋白的封闭液,如脱脂奶粉 |
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抗体类型 |
生物素标记抗体,禁用含内源性生物素的鱼明胶 |
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检测灵敏度 |
低丰度蛋白选择使用低浓度封闭液 |
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实验成本与时效 |
选脱脂奶粉,经济实惠。商品化的快速封闭液可缩短实验时间 |
1. RIPA裂解液(强、中、弱)
一种传统的用于裂解细胞或组织的快速裂解液,适用于总蛋白、膜蛋白、核蛋白的提取。在提取过程中裂解液对蛋白变性影响较小,简单易用。
RIPA裂解液的配方有很多种,根据其裂解强度分为强、中、弱三类。
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裂解液种类 |
主要组分 |
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强RIPA |
50mM Tris (pH 7.4)、150mM NaCl、1% Triton X-100、1% 脱氧胆酸钠、0.1% SDS、1 mM EDTA |
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中RIPA |
50mM Tris (pH 7.4)、150mM NaCl、1% NP-40,0.5% 脱氧胆酸钠,1 mM EDTA |
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弱RIPA |
50mM Tris (pH 7.4)、150mM NaCl、1% NP-40,0.25% 脱氧胆酸钠,1 mM EDTA |
2. SDS裂解液
裂解效果强烈,可以轻松破坏细胞膜、核膜,使细胞内容物释放出来。常用于需要强烈破坏细胞结构提取蛋白的场景。在进行蛋白提取时,加入SDS裂解液后,建议再进行超声破碎,能让蛋白更加充分地释放出来。
常用配方:50mM Tris-HCl (pH 6.8-8.5)、1-2% SDS、100mM DTT,部分配方中会添加5-10%的甘油以稳定蛋白质结构,少数还有150 mM的NaCl以维持离子强度。蛋白酶抑制剂需另加。
3. Tris-Triton裂解液
利用非离子型去污剂Triton X-100破坏脂质双分子层,裂解细胞膜及细胞器膜,释放胞质蛋白,同时保留核膜完整性。裂解条件较为温和,能较好的保持蛋白质活性及结构。可用于提取细胞骨架蛋白。
常用配方:10 mM Tris-HCl (pH 7.4)、100 mM NaCl、1 mM EDTA、1 mM EDTA、1% Triton X-100、10% 甘油、0.1% SDS、0.5% 脱氧胆酸盐
4. NP-40裂解液
利用非离子型去污剂NP-40破坏脂质双分子层,适用于胞质蛋白提取,部分情况下需联合RIPA裂解液使用。不能用于核蛋白提取。
常用配方:50 mM Tris-HCl (pH 8.0)、150 mM NaCl、1% NP-40
5. ACK裂解液
即红细胞裂解液,主要效应组分为氯化铵。利用细胞内外的离子浓度差形成渗透压差,外部水分扩散至细胞内,使红细胞膨胀裂解。可用于组织蛋白提取过程中红细胞的去除。
常用配方:150mM NH4Cl、10mM KHCO、0.1mM Na2EDTA。
6. Urea裂解液
利用尿素的渗透压特性,使细胞膜破裂,释放出细胞内的物质。裂解效力高,能够有效地裂解多种类型的细胞,包括细菌、真菌和哺乳动物细胞。
常用配方:7-8M Urea、2M Thiourea、10 mM Tris-HCl (pH 8.0)、1% NP-40、0.5% Triton X-100、60-100 mM DTT等。
7. WB/IP裂解液
非变性条件下裂解细胞或组织样品的裂解液,可高效溶解蛋白质。裂解能力较为温和,可维持原有蛋白间的相互作用。
常用配方:20mM Tris-HCl (pH 7.5)、150mM NaCl、1% TritonX-100、EDTA等。
8. Tris-HCl裂解液
以Tris缓冲体系为核心的非变性裂解液,裂解能力缓和,能有效裂解细胞膜,不会破坏蛋白质结构。
常用配方:20-50 mM Tris-HCl (pH 7.4-7.6)、150mM NaCl、1% TritonX-100或NP-40、EDTA等。
总之提取不同亚细胞蛋白组分时需要不同的裂解液,且不同的裂解液对于不同位置的蛋白提取能力也不同,因此,我们需要根据蛋白质的定位选择合适的裂解液。
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蛋白质 |
推荐裂解液 |
有效裂解成分 |
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全细胞 |
NP-40、Triton X-100或强RIPA |
1% NP-40、1% Triton X-100、1% 脱氧胆酸钠、0.1% SDS |
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细胞质(可溶) |
Tris-HCl |
1% TritonX-100或NP-40 |
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细胞骨架蛋白 |
Tris-Triton |
1% Triton X-100、0.1% SDS、0.5% 脱氧胆酸盐 |
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细胞膜蛋白 |
RIPA |
1% TritonX-100或NP-40 |
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细胞核蛋白 |
RIPA |
1% TritonX-100或NP-40 |
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线粒体蛋白 |
RIPA |
1% TritonX-100或NP-40 |
03 蛋白样品制备“急救包”
Tips 1:裂解液的pH值要合适,太高或太低都可能会引起蛋白质的变性、析出,一般选择Tris-HCl缓冲能力强的体系。
Tips 2:盐离子浓度保持一致,且尽量接近生理状态。盐离子浓度不一致可能会导致蛋白条带宽窄不一。盐离子浓度过高会造成蛋白盐析,在电泳过程中会导致蛋白往两边扩散,使得条带越来越宽,最后连在一起,或者出现笑脸条带。
Tips 3:提取的样本要尽可能新鲜,在裂解前几分钟加入相应的蛋白酶抑制剂。
Tips 4:提取全过程要保持低温操作(冰上),使用的试剂和耗材要提前预冷,提取后的样本保存过程中要避免多次反复冻融。
Tips 5:提取的蛋白样品如果出现透明胶状物,可能是基因组DNA等复合物,可加入核酸酶并超声处理,以降低样品粘稠度。
Tips 6:如果组织样本中血液含量较多,需要多次清洗,尽量把血液去除干净,或用红细胞裂解液处理后再进行蛋白提取。
Tips 7:对于易破碎软组织,如肝脏、脑等,可在剪碎后加入适量的裂解液,利用玻璃匀浆器进行充分研磨后冰上裂解10-30 min。
Tips 8:对于硬度大、韧性强或易降解样品,如软骨、皮肤、消化系统相关组织,可先用液氮研磨成细粉,再加入适量裂解液进行裂解。
最后,敲黑板划重点啦!无论使用那种裂解液,都建议在裂解处理后进行超声破碎,使蛋白充分释放。超声处理要充分,以裂解液变得清澈不黏稠为准。细胞培养物超声处理选择多次短暂循环方式,如打1-3秒停2-5秒,重复5-10次,超声裂解过程中在冰上操作,避免样品降解。
无论您是刚开始接触WB实验,还是WB老手,我们都要时刻注意样本制备的细节,才能不浪费宝贵的时间、精力和试剂。