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北京义翘神州科技股份有限公司(Sino Biological Inc.)
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北京
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技术服务、试剂、抗体、细胞库 / 细胞培养、ELISA 试剂盒
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Recombinant Human PD-L1 / B7-H1 / CD274 Protein (Fc Tag) | 重组人 PD-L1 / B7-H1 / CD274 蛋白 (Fc标签)
品牌:Sino Biological
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咨询公司新闻/正文
近期新冠病毒突变体研究进展及相关科研试剂
人阅读 发布时间:2021-01-27 15:21
根据国家生物信息中心网站数据(CNCB),显示新冠病毒S蛋白已有3225个位点发生突变,其中引起氨基酸变化的突变共1930个,位于蛋白受体结合域(RBD)的氨基酸突变有253个。最近有3株新冠病毒突变株引起全世界广泛关注,分别是英国B.1.1.7突变株、南非B.1.351突变株和巴西P.1突变株。在1月20日北京市第215场新冠防控工作发布会上,庞星火副主任介绍已完成对17日大兴区报道的2例确诊病例的全基因组测序和分析,发现与英国突变株(B.1.1.7)同源,为境外输入。
新冠病毒通过Spike蛋白受体结合域RBD识别并结合宿主细胞表面受体ACE2,介导病毒包膜与细胞膜融合过程,使得S蛋白成为中和抗体和疫苗的主要抗原靶点,因此S蛋白(尤其是RBD)的位点突变也是人们关注的重点。
RBD突变可能会增强与受体结合的亲和力、减弱中和抗体效应或者造成病毒免疫逃逸。据《Cell》报道,Q493、Q498和N501位点突变会提高病毒与人体细胞表面ACE2受体的亲和力,增强新冠病毒的传染力。在小鼠模型中,通过实验已经证实N501Y能够增强病毒与人和小鼠ACE的结合亲和力。Furin蛋白酶切割位点对宿主细胞结合能力影响巨大,而P681H突变靠近Furin酶切位点,可能是S蛋白与ACE2亲和力提高千倍的因素。69-70del可能有利于病毒逃逸宿主免疫反应。
英国B.1.1.7突变株
研究发现此突变株毒株有23个特殊的突变,包括14个非同义突变(氨基酸改变)、6个同义突变(非氨基酸改变)和3个删除,这是首次发现在一个毒株上出现如此多的变异。这其中有8个突变均发生在Spike蛋白上,以下3个突变位点尤其引起研究者的关注,并且需要加强对其监测。
-- N501Y,可增强新冠病毒与人或者鼠ACE2的结合
-- 69-70del,可引起免疫逃逸
-- P681H,靠近Furin酶切位点
义翘神州已成功开发多种与此突变位点相关的产品,可以用于新冠病毒的中和抗体及疫苗研究。
南非B.1.351突变株
根据南非相关单位的研究数据,发现突变株主要是Spike蛋白存在8个突变,其中包括RBD的3个重要残基:K471N、E484K和N501Y。其中E484K和N501Y属于受体结合基序,是与人ACE2受体结合的主要位点。
南非突变体位点(来自medRxiv)
对南非突变体的研究发现了最令人担忧的事情。1月19日美国的研究团队在bioRxiv的预印本文章,发现mRNA新冠疫苗对南非突变株的防护能力可能有所下降,研究人员从接种疫苗的志愿者体内分离出中和抗体,其中有22种抗体对南非突变体中的一种突变位点的中和活性下降超过5倍。这提醒我们需要加强对新冠病毒突变体的持续监测。
义翘神州同样开发出南非突变体相关产品供科学研究使用。
巴西P.1突变株
根据Faria等13日在Virological提交的报告,发现存在K417T、E484K、N501Y等多个位点的突变。
巴西突变株系统进化树及突变位点(来自Virological)
义翘神州根据已发布的序列信息,体外重组表达相关突变位点的蛋白,可以用于新冠病毒相关的研究。
水貂突变株
根据SSI的研究报告,丹麦水貂体内分离出5中突变株,其中Y453F具有重要研究意义。Y453F突变体新冠病毒Spike蛋白第453位的氨基酸由酪氨酸(Y)突变为苯丙氨酸(F),可能是为了更适应水貂宿主。除Y453F突变之外,还包括:69-70del、692V、S1147L、M1229I等。
义翘神州目前已开发出两种水貂相关的突变体重组蛋白。
现在,义翘神州已开发80多种重组Spike、N抗原突变体蛋白,涵盖了包括上述提及的突变位点在内的多种突变位点。具体位点点击图片了解
参考文献:
新冠病毒通过Spike蛋白受体结合域RBD识别并结合宿主细胞表面受体ACE2,介导病毒包膜与细胞膜融合过程,使得S蛋白成为中和抗体和疫苗的主要抗原靶点,因此S蛋白(尤其是RBD)的位点突变也是人们关注的重点。
RBD突变可能会增强与受体结合的亲和力、减弱中和抗体效应或者造成病毒免疫逃逸。据《Cell》报道,Q493、Q498和N501位点突变会提高病毒与人体细胞表面ACE2受体的亲和力,增强新冠病毒的传染力。在小鼠模型中,通过实验已经证实N501Y能够增强病毒与人和小鼠ACE的结合亲和力。Furin蛋白酶切割位点对宿主细胞结合能力影响巨大,而P681H突变靠近Furin酶切位点,可能是S蛋白与ACE2亲和力提高千倍的因素。69-70del可能有利于病毒逃逸宿主免疫反应。
英国B.1.1.7突变株
研究发现此突变株毒株有23个特殊的突变,包括14个非同义突变(氨基酸改变)、6个同义突变(非氨基酸改变)和3个删除,这是首次发现在一个毒株上出现如此多的变异。这其中有8个突变均发生在Spike蛋白上,以下3个突变位点尤其引起研究者的关注,并且需要加强对其监测。
-- N501Y,可增强新冠病毒与人或者鼠ACE2的结合
-- 69-70del,可引起免疫逃逸
-- P681H,靠近Furin酶切位点
义翘神州已成功开发多种与此突变位点相关的产品,可以用于新冠病毒的中和抗体及疫苗研究。
英国突变株B.1.1.7重要突变位点研究
货号 | 订购 | 抗原 | 突变位点 |
40592-V08H82 | 现货 | RBD | N501Y |
40591-V08H7 | 现货 | S1 | HV69-70 deletion, N501Y, D614G |
40591-V08H12 | 现货 | S1 | H69del, V70del, Y144del, N501Y, A570D, D614G, P681H |
40588-V07E7 | 现货 | N | D3L, R203K, G204R, S235F |
40588-V07E8 | 现货 | N | D3L, S235F |
40589-V08B6 | 开发中 | S-ECD | H69del, V70del, Y144del, N501Y, A570D, D614G, P681H, T716I, S982A, D1118H |
南非B.1.351突变株
根据南非相关单位的研究数据,发现突变株主要是Spike蛋白存在8个突变,其中包括RBD的3个重要残基:K471N、E484K和N501Y。其中E484K和N501Y属于受体结合基序,是与人ACE2受体结合的主要位点。
南非突变体位点(来自medRxiv)
对南非突变体的研究发现了最令人担忧的事情。1月19日美国的研究团队在bioRxiv的预印本文章,发现mRNA新冠疫苗对南非突变株的防护能力可能有所下降,研究人员从接种疫苗的志愿者体内分离出中和抗体,其中有22种抗体对南非突变体中的一种突变位点的中和活性下降超过5倍。这提醒我们需要加强对新冠病毒突变体的持续监测。
义翘神州同样开发出南非突变体相关产品供科学研究使用。
南非突变株B.1.351重要突变位点研究
货号 | 订购 | 抗原 | 突变位点 |
40592-V08H82 | 现货 | RBD | N501Y |
40592-V08H84 | 现货 | RBD | E484K |
40592-V08H59 | 现货 | RBD | K417N |
40591-V08H10 | 现货 | S1 | K417N, E484K, N501Y, D614G |
巴西P.1突变株
根据Faria等13日在Virological提交的报告,发现存在K417T、E484K、N501Y等多个位点的突变。
巴西突变株系统进化树及突变位点(来自Virological)
义翘神州根据已发布的序列信息,体外重组表达相关突变位点的蛋白,可以用于新冠病毒相关的研究。
巴西突变株P.1重要突变位点研究
货号 | 订购 | 抗原 | 突变位点 |
40592-V08H82 | 现货 | RBD | N501Y |
40592-V08H84 | 现货 | RBD | E484K |
水貂突变株
根据SSI的研究报告,丹麦水貂体内分离出5中突变株,其中Y453F具有重要研究意义。Y453F突变体新冠病毒Spike蛋白第453位的氨基酸由酪氨酸(Y)突变为苯丙氨酸(F),可能是为了更适应水貂宿主。除Y453F突变之外,还包括:69-70del、692V、S1147L、M1229I等。
义翘神州目前已开发出两种水貂相关的突变体重组蛋白。
水貂突变株重要突变位点研究
货号 | 订购 | 抗原 | 突变位点 |
40592-V08H80 | 现货 | RBD | Y453F |
40591-V08H8 | 现货 | S1 | ΔH69/ΔV70, Y453F, D614G |
现在,义翘神州已开发80多种重组Spike、N抗原突变体蛋白,涵盖了包括上述提及的突变位点在内的多种突变位点。具体位点点击图片了解
参考文献:
- https://virological.org/t/preliminary-genomic-characterisation-of-an-emergent-sars-cov-2-lineage-in-the-uk-defined-by-a-novel-set-of-spike-mutations/563
- The Impact of Mutations in SARS-CoV-2 Spike on Viral Infectivity and Antigenicity.
- Tegally, et al. Emergence and rapid spread of a new severe acute respiratory syndrome-related coronavirus 2 (SARS-CoV-2) lineage with multiple spike mutations in South Africa. medRxiv
- Faria, et al. Genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in Manaus: preliminary findings. https://virological.org
- SARS-CoV-2 spike mutations arising in Danish mink and their spread to humans. Working paper of SSI.
- Wang, et al. mRNA vaccine-elicited antibodies to SARS-CoV-2 and circulating variants. bioRxiv