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北京义翘神州科技股份有限公司(Sino Biological Inc.)
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技术服务、试剂、抗体、细胞库 / 细胞培养、ELISA 试剂盒
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Recombinant Human PD-L1 / B7-H1 / CD274 Protein (Fc Tag) | 重组人 PD-L1 / B7-H1 / CD274 蛋白 (Fc标签)
品牌：Sino Biological
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再创佳绩，义翘神州再次高效率成功表达N501Y突变体重组蛋白
人阅读 发布时间：2020-12-29 09:55
近期，英国出现的新冠病毒突变体引起全世界的关注，“传染性高出70%”、“伦敦紧急封城”、“大量民众逃离”等等。为应对新冠病毒新变种，目前已有超过40个国家对英国实施入境禁令，我国在24日暂停中英间的往返航班。据世卫组织表示已有5国出现类似病例，在23日，以色列、新加坡和香港特区也有新毒株病例出现。
那么新毒株到底有多危险呢？目前科学界对它的了解又有多少？
英国突变位点之多创历史
我们结合英国科学家在virological.org上传的新突变株序列，以及《science》杂志发表的一篇报道，对暂时命名为B.1.1.7亚型的新毒株（英国将病毒命名为“VUI-202012/01”，即“2020年12月1日出现的待调查毒株”）已知情况进行了梳理。
（源自GISAID，新冠病毒Spike突变体的3D结构，其中青蓝为69-70del、145del突变，宝蓝为D614G、A570D、P681H、T716I、S982A、D1118H突变，黄色为N501Y突变）
爱丁堡大学的Andrew Rambaut上传的序列中，指出这个新毒株有23个特殊的突变，这是首次发现在一个毒株上出现如此多的变异。序列显示B.1.1.7亚型是在广泛流行的D614G突变株基础上发生突变。其中有8个突变发生在刺突蛋白Spike上，包含69-70缺失、145缺失及N501Y、A570D、D614G、P681H、T716I、S982A、D1118H突变；其次ORF8和ORF1ab也有多个位点发生突变。
（源自virological.org）
关于N501Y突变
据《Cell》报道，刺突蛋白是新冠病毒表面与人体细胞ACE2受体结合的部位，而刺突蛋白Q493、Q498和N501位点突变会提高病毒与人体细胞表面ACE2受体的亲和力，增强新冠病毒的传染力。因此科学家推测英国出现的突变株传染性提高70%，极有可能与N501Y突变有关。
在刺突蛋白的受体结合域RBD有6个关键的受体接触残基，而N501正是其中之一。在小鼠模型中，通过实验已经证实N501Y能够增强病毒与人和小鼠ACE的结合亲和力。
近日也有报道南非出现新的病毒突变体，同样发现存在N501Y突变。南非卫生部门发现，该突变体在刺突蛋白的受体结合域存在3个位点突变：K417N、E484K和N501Y。其中E484K和N501Y属于受体结合基序，是与人ACE2受体形成结合的主要位点。
（源自GISAID，新冠病毒Spike突变体的3D结构，左侧为ON状态，右侧为OFF状态，其中黑色为D80A、D215G突变，蓝色为D614G、A701V突变，黄色为N501Y、E484K、K417N突变，绿色表示ACE2）
但是N501Y突变是否对变异病毒的传染性及其对疾病严重性的影响意味着什么，还是未知数，需要更多的实验进行验证。
关于69-70缺失
69-70缺失，会导致刺突蛋白69-70位的两个氨基酸缺失，已在多个RBD相关突变的谱系中发现，比如丹麦水貂突变体中，同样存在69-70缺失。研究人员在一些免疫功能低下的患者中，发现这种突变可能有利于病毒逃逸宿主的免疫反应。也就是说69-70del可能会造成人体免疫系统无法识别新冠病毒。
关于新冠病毒突变
7月份，我国科学家在《Cell》发文，对新冠病毒变异进行系统性研究和介绍，从已知的刺突蛋白基因序列上鉴定出106个变异位点。《Science》也有相关的报道，称12月病毒毒株至少存在200个位点上的不同，与“初代”新冠病毒相比。
3月，D614G突变株成为欧洲的主要流行株，使病毒的感染率提高2.4-7.7倍。此后，多数突变株是在此基础上进行变异的，比如丹麦水貂突变Y453F，以及近期出现的英国突变N501Y和南非突变株。
关于突变体，人们出了关心其传染能力是否增强，更多的关注是疫苗是否还有用？王晨光教授曾在《新冠病毒变异可怕吗？》中指出，英国新突变株虽然有8个突变在刺突蛋白上，但引起较大的蛋白质构象变化的可能性较小。《Science》、美联社等媒体也引用多名专家的分析，认为突变对疫苗的影响不大，但是还需要更多的实验数据证实。
义翘神州已经建立全球新冠病毒突变株抗原库，目前上线RBD突变株重组蛋白以及超过70种，支持科研人员进行突变株对新冠病毒传播、临床、诊断、疫苗及药物开发影响的研究。
1.https://virological.org/t/preliminary-genomic-characterisation-of-an-emergent-sars-cov-2-lineage-in-the-uk-defined-by-a-novel-set-of-spike-mutations/563
2.https://www.sciencemag.org/news/2020/12/mutant-coronavirus-united-kingdom-sets-alarms-its-importance-remains-unclear
那么新毒株到底有多危险呢？目前科学界对它的了解又有多少？
英国突变位点之多创历史
我们结合英国科学家在virological.org上传的新突变株序列，以及《science》杂志发表的一篇报道，对暂时命名为B.1.1.7亚型的新毒株（英国将病毒命名为“VUI-202012/01”，即“2020年12月1日出现的待调查毒株”）已知情况进行了梳理。
（源自GISAID，新冠病毒Spike突变体的3D结构，其中青蓝为69-70del、145del突变，宝蓝为D614G、A570D、P681H、T716I、S982A、D1118H突变，黄色为N501Y突变）
爱丁堡大学的Andrew Rambaut上传的序列中，指出这个新毒株有23个特殊的突变，这是首次发现在一个毒株上出现如此多的变异。序列显示B.1.1.7亚型是在广泛流行的D614G突变株基础上发生突变。其中有8个突变发生在刺突蛋白Spike上，包含69-70缺失、145缺失及N501Y、A570D、D614G、P681H、T716I、S982A、D1118H突变；其次ORF8和ORF1ab也有多个位点发生突变。
（源自virological.org）
关于N501Y突变
据《Cell》报道，刺突蛋白是新冠病毒表面与人体细胞ACE2受体结合的部位，而刺突蛋白Q493、Q498和N501位点突变会提高病毒与人体细胞表面ACE2受体的亲和力，增强新冠病毒的传染力。因此科学家推测英国出现的突变株传染性提高70%，极有可能与N501Y突变有关。
在刺突蛋白的受体结合域RBD有6个关键的受体接触残基，而N501正是其中之一。在小鼠模型中，通过实验已经证实N501Y能够增强病毒与人和小鼠ACE的结合亲和力。
近日也有报道南非出现新的病毒突变体，同样发现存在N501Y突变。南非卫生部门发现，该突变体在刺突蛋白的受体结合域存在3个位点突变：K417N、E484K和N501Y。其中E484K和N501Y属于受体结合基序，是与人ACE2受体形成结合的主要位点。
（源自GISAID，新冠病毒Spike突变体的3D结构，左侧为ON状态，右侧为OFF状态，其中黑色为D80A、D215G突变，蓝色为D614G、A701V突变，黄色为N501Y、E484K、K417N突变，绿色表示ACE2）
但是N501Y突变是否对变异病毒的传染性及其对疾病严重性的影响意味着什么，还是未知数，需要更多的实验进行验证。
关于69-70缺失
69-70缺失，会导致刺突蛋白69-70位的两个氨基酸缺失，已在多个RBD相关突变的谱系中发现，比如丹麦水貂突变体中，同样存在69-70缺失。研究人员在一些免疫功能低下的患者中，发现这种突变可能有利于病毒逃逸宿主的免疫反应。也就是说69-70del可能会造成人体免疫系统无法识别新冠病毒。
关于新冠病毒突变
7月份，我国科学家在《Cell》发文，对新冠病毒变异进行系统性研究和介绍，从已知的刺突蛋白基因序列上鉴定出106个变异位点。《Science》也有相关的报道，称12月病毒毒株至少存在200个位点上的不同，与“初代”新冠病毒相比。
3月，D614G突变株成为欧洲的主要流行株，使病毒的感染率提高2.4-7.7倍。此后，多数突变株是在此基础上进行变异的，比如丹麦水貂突变Y453F，以及近期出现的英国突变N501Y和南非突变株。
关于突变体，人们出了关心其传染能力是否增强，更多的关注是疫苗是否还有用？王晨光教授曾在《新冠病毒变异可怕吗？》中指出，英国新突变株虽然有8个突变在刺突蛋白上，但引起较大的蛋白质构象变化的可能性较小。《Science》、美联社等媒体也引用多名专家的分析，认为突变对疫苗的影响不大，但是还需要更多的实验数据证实。
义翘神州已经建立全球新冠病毒突变株抗原库，目前上线RBD突变株重组蛋白以及超过70种，支持科研人员进行突变株对新冠病毒传播、临床、诊断、疫苗及药物开发影响的研究。
1.https://virological.org/t/preliminary-genomic-characterisation-of-an-emergent-sars-cov-2-lineage-in-the-uk-defined-by-a-novel-set-of-spike-mutations/563
2.https://www.sciencemag.org/news/2020/12/mutant-coronavirus-united-kingdom-sets-alarms-its-importance-remains-unclear
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